运用１４个有效的１０ｍｅｒ 寡核苷酸引物对中药溪黄草原植物线纹香茶菜Ｉｓｏｄｏｎｌｏ ｐｈａｎｔｈｏｉｄｅｓ及其药作近缘种基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增，共检出１９４个位点．其中单态位点１４个，占７２％；多态位点１８０个，占９２８％；分类群特有位点１０８个，占５５７％．用ＵＰＧＭＡ法对分类群间的Ｊａｃａｒｄ相似性系数和遗传距离进行聚类分析．结果表明，狭基线纹香茶菜和细花线纹香茶菜与溪黄草的亲缘关系较近，而溪黄草与线纹香茶菜、狭基线纹香茶菜、细花线纹香茶菜之间的亲缘关系远．可用ＲＡＰＤ技术对中药的正本清源、真伪品及质量进行研究．