西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析

冯燕丽; 马欣荣; 夏庆杰; 谈心; 张义正

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西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析

研究论文 | 更新时间：2023-12-11

- 西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析
- The Screening and Analysis of Differentially Expressed Genes from Rhizome of 〖WTBX〗Picrorhiza Scrophulariiflora
- 中山大学学报(自然科学版)(中英文) 2009年48卷第2期页码：76-83
- 作者机构：
  
  1. 四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室,四川,成都,610064
  2. 
  3. 中国科学院成都生物研究所,四川,成都,610041
  4. 四川大学华西医学院,四川,成都,610044
- 作者简介：
- 基金信息：
- DOI：
  中图分类号：
- 纸质出版日期：2009，
  
  网络出版日期：2009-3-25，
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冯燕丽, 马欣荣, 夏庆杰, 等. 西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析[J]. 中山大学学报(自然科学版)(中英文), 2009,48(2):76-83.

FENG Yanli, MA Xinrong , XIA Qingjie, et al. The Screening and Analysis of Differentially Expressed Genes from Rhizome of 〖WTBX〗Picrorhiza Scrophulariiflora[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis SunYatseni, 2009,48(2):76-83.
冯燕丽, 马欣荣, 夏庆杰, 等. 西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析[J]. 中山大学学报(自然科学版)(中英文), 2009,48(2):76-83. DOI：

FENG Yanli, MA Xinrong , XIA Qingjie, et al. The Screening and Analysis of Differentially Expressed Genes from Rhizome of 〖WTBX〗Picrorhiza Scrophulariiflora[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis SunYatseni, 2009,48(2):76-83. DOI：

摘要

西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材

其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官，萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因，利用抑制消减杂交技术，构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑取片段不一的阳性克隆测序，采用Blastx进行同源比对，获得了27个表达序列标签（EST），并获登录号。序列统计分析结果表明，其中有11个EST在GenBank中无同源性序列，推测可能是新基因片断。蛋白质功能分类结果表明，这些蛋白质与翻译、能量代谢、转运与结合、细胞膜合成、氨基酸生物合成及中间代谢6大类蛋白功能有关。为深入研究与萜类生物合成直接或间接相关基因，选择了长595 bp的差异表达EST序列EX172715进行了同源比对和蛋白系统进化分析。结果表明，EX172715具有细胞色素P450单加氧酶的特征结构，与拟南芥的细胞色素P450单加氧酶蛋白的同源性高于水稻和小麦。提供了一组与西藏胡黄连次生代谢相关的新基因库。

Abstract

Key words:

Picrorhiza scrophulariiflora

rhizome-specific genes

suppression subtractive hybridization

ESTs

phylogenetic analysis

cytochrome P450 monooxygenase

关键词

西藏胡黄连根状茎特异表达基因抑制消减杂交表达序列标签同源性分析细胞色素P450单加氧酶

Keywords

Picrorhiza scrophulariiflorarhizome-specific genessuppression subtractive hybridizationESTsphylogenetic analysiscytochrome P450 monooxygenase

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